Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D3P61077 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D3P61077 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms