Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG1BP48304 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG1BP48304 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REG1BP48304 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG1BP48304 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG1BP48304 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2094.9 ms