Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPA2P48052 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPA2P48052 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPA2P48052 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA2P48052 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA2P48052 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA2P48052 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA2P48052 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPA2P48052 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPA2P48052 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPA2P48052 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA2P48052 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA2P48052 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA2P48052 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA2P48052 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA2P48052 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA2P48052 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA2P48052 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA2P48052 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA2P48052 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms