Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCND3P30281 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCND3P30281 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCND3P30281 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCND3P30281 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCND3P30281 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCND3P30281 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND3P30281 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND3P30281 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND3P30281 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCND3P30281 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND3P30281 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND3P30281 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND3P30281 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND3P30281 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCND3P30281 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCND3P30281 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCND3P30281 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCND3P30281 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCND3P30281 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCND3P30281 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCND3P30281 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCND3P30281 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND3P30281 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND3P30281 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND3P30281 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND3P30281 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCND3P30281 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND3P30281 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND3P30281 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND3P30281 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND3P30281 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCND3P30281 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms