Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAMP11215 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAMP11215 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms