Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMFO60524 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEMFO60524 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEMFO60524 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMFO60524 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMFO60524 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMFO60524 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEMFO60524 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMFO60524 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMFO60524 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMFO60524 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEMFO60524 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEMFO60524 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEMFO60524 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEMFO60524 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMFO60524 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMFO60524 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMFO60524 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMFO60524 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEMFO60524 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMFO60524 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMFO60524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMFO60524 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMFO60524 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEMFO60524 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMFO60524 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMFO60524 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMFO60524 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMFO60524 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEMFO60524 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMFO60524 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMFO60524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMFO60524 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEMFO60524 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMFO60524 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMFO60524 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMFO60524 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMFO60524 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEMFO60524 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEMFO60524 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEMFO60524 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMFO60524 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMFO60524 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMFO60524 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEMFO60524 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms