Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBY3A6NI87 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms