Protein–RNA interactions for Protein: A6NE52

WDR97, WD repeat-containing protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 1,622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR97A6NE52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
WDR97A6NE52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
WDR97A6NE52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
WDR97A6NE52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
WDR97A6NE52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
WDR97A6NE52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms