Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
V9GYQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
V9GYQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
V9GYQ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYQ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms