Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
U3KQE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U3KQE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
U3KQE9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U3KQE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U3KQE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQE9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms