Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARFGEF1Q9Y6D6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARFGEF1Q9Y6D6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFGEF1Q9Y6D6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms