Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDV3Q9UKY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDV3Q9UKY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1320.2 ms