Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK12Q9NYV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK12Q9NYV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDK12Q9NYV4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms