Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BCANQ96GW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BCANQ96GW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms