Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC38A9Q8NBW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms