Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N3U1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8N3U1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8N3U1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8N3U1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8N3U1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8N3U1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8N3U1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N3U1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N3U1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N3U1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms