Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC83Q8IWF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC83Q8IWF9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms