Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGDCC3Q8IVU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGDCC3Q8IVU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGDCC3Q8IVU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGDCC3Q8IVU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGDCC3Q8IVU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGDCC3Q8IVU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGDCC3Q8IVU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms