Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRSAM1Q6UWE0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRSAM1Q6UWE0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms