Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG9BQ674R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9BQ674R7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms