Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00242Q5T6M2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00242Q5T6M2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00242Q5T6M2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms