Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD4Q53EL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD4Q53EL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms