Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F4Q16254 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms