Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA0040Q15053 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA0040Q15053 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA0040Q15053 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms