Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EP300Q09472 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EP300Q09472 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EP300Q09472 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EP300Q09472 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EP300Q09472 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EP300Q09472 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EP300Q09472 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EP300Q09472 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP300Q09472 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP300Q09472 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EP300Q09472 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP300Q09472 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP300Q09472 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP300Q09472 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP300Q09472 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP300Q09472 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP300Q09472 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP300Q09472 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP300Q09472 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP300Q09472 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP300Q09472 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP300Q09472 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EP300Q09472 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EP300Q09472 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EP300Q09472 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EP300Q09472 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EP300Q09472 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EP300Q09472 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EP300Q09472 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EP300Q09472 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EP300Q09472 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EP300Q09472 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 900.1 ms