Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBXN2AP68543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN2AP68543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms