Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UTRNP46939 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UTRNP46939 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UTRNP46939 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UTRNP46939 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UTRNP46939 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UTRNP46939 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UTRNP46939 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UTRNP46939 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UTRNP46939 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UTRNP46939 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
UTRNP46939 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UTRNP46939 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UTRNP46939 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UTRNP46939 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UTRNP46939 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UTRNP46939 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UTRNP46939 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UTRNP46939 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UTRNP46939 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UTRNP46939 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UTRNP46939 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UTRNP46939 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UTRNP46939 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UTRNP46939 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UTRNP46939 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UTRNP46939 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UTRNP46939 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UTRNP46939 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UTRNP46939 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UTRNP46939 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UTRNP46939 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UTRNP46939 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UTRNP46939 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UTRNP46939 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UTRNP46939 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UTRNP46939 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UTRNP46939 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UTRNP46939 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UTRNP46939 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UTRNP46939 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UTRNP46939 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UTRNP46939 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UTRNP46939 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UTRNP46939 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UTRNP46939 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms