Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS4Y1P22090 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS4Y1P22090 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms