Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRMP19623 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRMP19623 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRMP19623 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRMP19623 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRMP19623 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRMP19623 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRMP19623 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRMP19623 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRMP19623 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRMP19623 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRMP19623 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRMP19623 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRMP19623 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRMP19623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRMP19623 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRMP19623 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRMP19623 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRMP19623 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRMP19623 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRMP19623 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRMP19623 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRMP19623 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRMP19623 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRMP19623 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRMP19623 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRMP19623 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms