Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA6AP0CW24 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA6AP0CW24 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms