Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN2P04844 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN2P04844 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN2P04844 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN2P04844 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN2P04844 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN2P04844 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN2P04844 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPN2P04844 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN2P04844 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN2P04844 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN2P04844 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN2P04844 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN2P04844 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN2P04844 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN2P04844 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN2P04844 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN2P04844 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPN2P04844 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN2P04844 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms