Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB1P04280 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB1P04280 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB1P04280 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB1P04280 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB1P04280 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB1P04280 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB1P04280 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB1P04280 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRB1P04280 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRB1P04280 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRB1P04280 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB1P04280 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB1P04280 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB1P04280 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB1P04280 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB1P04280 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB1P04280 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB1P04280 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB1P04280 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRB1P04280 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRB1P04280 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRB1P04280 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB1P04280 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms