Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX3O95343 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX3O95343 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX3O95343 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX3O95343 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX3O95343 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX3O95343 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX3O95343 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX3O95343 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX3O95343 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX3O95343 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX3O95343 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX3O95343 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX3O95343 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX3O95343 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX3O95343 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX3O95343 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX3O95343 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX3O95343 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX3O95343 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX3O95343 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX3O95343 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX3O95343 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX3O95343 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX3O95343 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX3O95343 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX3O95343 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX3O95343 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX3O95343 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX3O95343 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX3O95343 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX3O95343 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX3O95343 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX3O95343 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX3O95343 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX3O95343 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX3O95343 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX3O95343 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms