Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD1B0YJ81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD1B0YJ81 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD1B0YJ81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms