Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L4A6NEF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L4A6NEF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms