Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U3KQA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U3KQA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U3KQA8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U3KQA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U3KQA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U3KQA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U3KQA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U3KQA8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U3KQA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U3KQA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U3KQA8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U3KQA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U3KQA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U3KQA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U3KQA8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
U3KQA8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U3KQA8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U3KQA8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U3KQA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U3KQA8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U3KQA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
U3KQA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U3KQA8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U3KQA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U3KQA8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U3KQA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U3KQA8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U3KQA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
U3KQA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U3KQA8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U3KQA8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U3KQA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U3KQA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U3KQA8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U3KQA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U3KQA8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U3KQA8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U3KQA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U3KQA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
U3KQA8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
U3KQA8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U3KQA8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
U3KQA8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U3KQA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U3KQA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
U3KQA8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U3KQA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U3KQA8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U3KQA8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U3KQA8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U3KQA8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U3KQA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
U3KQA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U3KQA8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U3KQA8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
U3KQA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U3KQA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U3KQA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
U3KQA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U3KQA8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U3KQA8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U3KQA8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U3KQA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U3KQA8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U3KQA8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U3KQA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U3KQA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U3KQA8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U3KQA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U3KQA8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U3KQA8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U3KQA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U3KQA8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U3KQA8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U3KQA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U3KQA8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U3KQA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U3KQA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U3KQA8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U3KQA8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U3KQA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U3KQA8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U3KQA8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U3KQA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U3KQA8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U3KQA8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U3KQA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U3KQA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U3KQA8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
U3KQA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U3KQA8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U3KQA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U3KQA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
U3KQA8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U3KQA8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
U3KQA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U3KQA8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U3KQA8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U3KQA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms