Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNCAIPQ9Y6H5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SNCAIPQ9Y6H5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SNCAIPQ9Y6H5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SNCAIPQ9Y6H5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SNCAIPQ9Y6H5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SNCAIPQ9Y6H5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNCAIPQ9Y6H5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNCAIPQ9Y6H5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SNCAIPQ9Y6H5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SNCAIPQ9Y6H5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SNCAIPQ9Y6H5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SNCAIPQ9Y6H5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SNCAIPQ9Y6H5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SNCAIPQ9Y6H5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SNCAIPQ9Y6H5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SNCAIPQ9Y6H5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNCAIPQ9Y6H5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNCAIPQ9Y6H5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SNCAIPQ9Y6H5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SNCAIPQ9Y6H5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SNCAIPQ9Y6H5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SNCAIPQ9Y6H5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SNCAIPQ9Y6H5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SNCAIPQ9Y6H5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SNCAIPQ9Y6H5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SNCAIPQ9Y6H5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SNCAIPQ9Y6H5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SNCAIPQ9Y6H5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SNCAIPQ9Y6H5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNCAIPQ9Y6H5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNCAIPQ9Y6H5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SNCAIPQ9Y6H5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNCAIPQ9Y6H5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNCAIPQ9Y6H5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SNCAIPQ9Y6H5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNCAIPQ9Y6H5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNCAIPQ9Y6H5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNCAIPQ9Y6H5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNCAIPQ9Y6H5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SNCAIPQ9Y6H5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SNCAIPQ9Y6H5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SNCAIPQ9Y6H5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNCAIPQ9Y6H5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SNCAIPQ9Y6H5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SNCAIPQ9Y6H5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNCAIPQ9Y6H5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNCAIPQ9Y6H5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNCAIPQ9Y6H5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SNCAIPQ9Y6H5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNCAIPQ9Y6H5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SNCAIPQ9Y6H5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SNCAIPQ9Y6H5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SNCAIPQ9Y6H5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNCAIPQ9Y6H5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNCAIPQ9Y6H5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNCAIPQ9Y6H5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNCAIPQ9Y6H5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNCAIPQ9Y6H5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNCAIPQ9Y6H5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNCAIPQ9Y6H5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SNCAIPQ9Y6H5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNCAIPQ9Y6H5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNCAIPQ9Y6H5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms