Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP24Q9UPU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP24Q9UPU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP24Q9UPU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP24Q9UPU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP24Q9UPU5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP24Q9UPU5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP24Q9UPU5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP24Q9UPU5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP24Q9UPU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP24Q9UPU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP24Q9UPU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP24Q9UPU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP24Q9UPU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP24Q9UPU5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP24Q9UPU5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP24Q9UPU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP24Q9UPU5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP24Q9UPU5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP24Q9UPU5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP24Q9UPU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP24Q9UPU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP24Q9UPU5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP24Q9UPU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP24Q9UPU5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP24Q9UPU5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP24Q9UPU5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP24Q9UPU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP24Q9UPU5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP24Q9UPU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP24Q9UPU5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP24Q9UPU5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP24Q9UPU5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP24Q9UPU5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP24Q9UPU5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP24Q9UPU5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP24Q9UPU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP24Q9UPU5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP24Q9UPU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP24Q9UPU5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP24Q9UPU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP24Q9UPU5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP24Q9UPU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP24Q9UPU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms