Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
TNIKQ9UKE5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
TNIKQ9UKE5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
TNIKQ9UKE5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
TNIKQ9UKE5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
TNIKQ9UKE5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
TNIKQ9UKE5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
TNIKQ9UKE5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
TNIKQ9UKE5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
TNIKQ9UKE5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
TNIKQ9UKE5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
TNIKQ9UKE5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
TNIKQ9UKE5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
TNIKQ9UKE5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
TNIKQ9UKE5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
TNIKQ9UKE5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
TNIKQ9UKE5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
TNIKQ9UKE5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
TNIKQ9UKE5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
TNIKQ9UKE5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
TNIKQ9UKE5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
TNIKQ9UKE5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
TNIKQ9UKE5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
TNIKQ9UKE5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
TNIKQ9UKE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
TNIKQ9UKE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
TNIKQ9UKE5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
TNIKQ9UKE5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
TNIKQ9UKE5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
TNIKQ9UKE5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
TNIKQ9UKE5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
TNIKQ9UKE5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
TNIKQ9UKE5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
TNIKQ9UKE5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
TNIKQ9UKE5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
TNIKQ9UKE5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
TNIKQ9UKE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47■■■■■ 5.12
TNIKQ9UKE5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
TNIKQ9UKE5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TNIKQ9UKE5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
TNIKQ9UKE5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.88■■■■■ 5.1
TNIKQ9UKE5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
TNIKQ9UKE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
TNIKQ9UKE5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
TNIKQ9UKE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
TNIKQ9UKE5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
TNIKQ9UKE5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
TNIKQ9UKE5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
TNIKQ9UKE5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
TNIKQ9UKE5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.66■■■■■ 5.06
TNIKQ9UKE5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
TNIKQ9UKE5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
TNIKQ9UKE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
TNIKQ9UKE5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TNIKQ9UKE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
TNIKQ9UKE5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
TNIKQ9UKE5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
TNIKQ9UKE5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
TNIKQ9UKE5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
TNIKQ9UKE5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
TNIKQ9UKE5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
TNIKQ9UKE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
TNIKQ9UKE5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
TNIKQ9UKE5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.42■■■■■ 5.02
TNIKQ9UKE5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
TNIKQ9UKE5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
TNIKQ9UKE5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
TNIKQ9UKE5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TNIKQ9UKE5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
TNIKQ9UKE5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
TNIKQ9UKE5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
TNIKQ9UKE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TNIKQ9UKE5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TNIKQ9UKE5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
TNIKQ9UKE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
TNIKQ9UKE5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
TNIKQ9UKE5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
TNIKQ9UKE5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms