Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP1BQ9NZR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP1BQ9NZR2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRP1BQ9NZR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRP1BQ9NZR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP1BQ9NZR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP1BQ9NZR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRP1BQ9NZR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP1BQ9NZR2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP1BQ9NZR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP1BQ9NZR2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP1BQ9NZR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP1BQ9NZR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRP1BQ9NZR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP1BQ9NZR2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP1BQ9NZR2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP1BQ9NZR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP1BQ9NZR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP1BQ9NZR2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP1BQ9NZR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP1BQ9NZR2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRP1BQ9NZR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP1BQ9NZR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP1BQ9NZR2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP1BQ9NZR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP1BQ9NZR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP1BQ9NZR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP1BQ9NZR2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP1BQ9NZR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP1BQ9NZR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP1BQ9NZR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP1BQ9NZR2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP1BQ9NZR2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP1BQ9NZR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP1BQ9NZR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP1BQ9NZR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms