Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC4BQ9NT99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC4BQ9NT99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC4BQ9NT99 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LRRC4BQ9NT99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
LRRC4BQ9NT99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
LRRC4BQ9NT99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC4BQ9NT99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC4BQ9NT99 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC4BQ9NT99 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC4BQ9NT99 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC4BQ9NT99 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC4BQ9NT99 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRC4BQ9NT99 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC4BQ9NT99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC4BQ9NT99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC4BQ9NT99 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC4BQ9NT99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC4BQ9NT99 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC4BQ9NT99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC4BQ9NT99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC4BQ9NT99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC4BQ9NT99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRC4BQ9NT99 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC4BQ9NT99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC4BQ9NT99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC4BQ9NT99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC4BQ9NT99 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC4BQ9NT99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC4BQ9NT99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC4BQ9NT99 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRC4BQ9NT99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRRC4BQ9NT99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRC4BQ9NT99 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC4BQ9NT99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC4BQ9NT99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRC4BQ9NT99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRC4BQ9NT99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRC4BQ9NT99 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRC4BQ9NT99 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRC4BQ9NT99 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC4BQ9NT99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRC4BQ9NT99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRRC4BQ9NT99 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC4BQ9NT99 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC4BQ9NT99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC4BQ9NT99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC4BQ9NT99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC4BQ9NT99 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC4BQ9NT99 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC4BQ9NT99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC4BQ9NT99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC4BQ9NT99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC4BQ9NT99 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC4BQ9NT99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC4BQ9NT99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC4BQ9NT99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC4BQ9NT99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC4BQ9NT99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRC4BQ9NT99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC4BQ9NT99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC4BQ9NT99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LRRC4BQ9NT99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC4BQ9NT99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC4BQ9NT99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC4BQ9NT99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRC4BQ9NT99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC4BQ9NT99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC4BQ9NT99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRC4BQ9NT99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRC4BQ9NT99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms