Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHARPINQ9H0F6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHARPINQ9H0F6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHARPINQ9H0F6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHARPINQ9H0F6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHARPINQ9H0F6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHARPINQ9H0F6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHARPINQ9H0F6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHARPINQ9H0F6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHARPINQ9H0F6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHARPINQ9H0F6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHARPINQ9H0F6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHARPINQ9H0F6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHARPINQ9H0F6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHARPINQ9H0F6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHARPINQ9H0F6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHARPINQ9H0F6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHARPINQ9H0F6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHARPINQ9H0F6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHARPINQ9H0F6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHARPINQ9H0F6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHARPINQ9H0F6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHARPINQ9H0F6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHARPINQ9H0F6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHARPINQ9H0F6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHARPINQ9H0F6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms