Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms