Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM5DQ9BY66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM5DQ9BY66 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
KDM5DQ9BY66 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
KDM5DQ9BY66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
KDM5DQ9BY66 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
KDM5DQ9BY66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KDM5DQ9BY66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KDM5DQ9BY66 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
KDM5DQ9BY66 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
KDM5DQ9BY66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
KDM5DQ9BY66 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM5DQ9BY66 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
KDM5DQ9BY66 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.59
KDM5DQ9BY66 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.59
KDM5DQ9BY66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KDM5DQ9BY66 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
KDM5DQ9BY66 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
KDM5DQ9BY66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
KDM5DQ9BY66 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
KDM5DQ9BY66 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
KDM5DQ9BY66 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
KDM5DQ9BY66 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KDM5DQ9BY66 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
KDM5DQ9BY66 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
KDM5DQ9BY66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
KDM5DQ9BY66 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
KDM5DQ9BY66 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
KDM5DQ9BY66 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.28■■■■■ 4.52
KDM5DQ9BY66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
KDM5DQ9BY66 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
KDM5DQ9BY66 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
KDM5DQ9BY66 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
KDM5DQ9BY66 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
KDM5DQ9BY66 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
KDM5DQ9BY66 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
KDM5DQ9BY66 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
KDM5DQ9BY66 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM5DQ9BY66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
KDM5DQ9BY66 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
KDM5DQ9BY66 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
KDM5DQ9BY66 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
KDM5DQ9BY66 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
KDM5DQ9BY66 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
KDM5DQ9BY66 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
KDM5DQ9BY66 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
KDM5DQ9BY66 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
KDM5DQ9BY66 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM5DQ9BY66 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
KDM5DQ9BY66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
KDM5DQ9BY66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
KDM5DQ9BY66 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
KDM5DQ9BY66 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
KDM5DQ9BY66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
KDM5DQ9BY66 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5DQ9BY66 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
KDM5DQ9BY66 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
KDM5DQ9BY66 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5DQ9BY66 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
KDM5DQ9BY66 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
KDM5DQ9BY66 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM5DQ9BY66 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM5DQ9BY66 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM5DQ9BY66 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
KDM5DQ9BY66 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
KDM5DQ9BY66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
KDM5DQ9BY66 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM5DQ9BY66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM5DQ9BY66 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
KDM5DQ9BY66 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
KDM5DQ9BY66 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM5DQ9BY66 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM5DQ9BY66 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM5DQ9BY66 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
KDM5DQ9BY66 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
KDM5DQ9BY66 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM5DQ9BY66 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
KDM5DQ9BY66 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5DQ9BY66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM5DQ9BY66 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM5DQ9BY66 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM5DQ9BY66 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM5DQ9BY66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM5DQ9BY66 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM5DQ9BY66 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM5DQ9BY66 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms