Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PLVAPQ9BX97 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PLVAPQ9BX97 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PLVAPQ9BX97 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PLVAPQ9BX97 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PLVAPQ9BX97 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PLVAPQ9BX97 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PLVAPQ9BX97 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PLVAPQ9BX97 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PLVAPQ9BX97 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PLVAPQ9BX97 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PLVAPQ9BX97 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PLVAPQ9BX97 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLVAPQ9BX97 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLVAPQ9BX97 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLVAPQ9BX97 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLVAPQ9BX97 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PLVAPQ9BX97 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PLVAPQ9BX97 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PLVAPQ9BX97 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PLVAPQ9BX97 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PLVAPQ9BX97 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PLVAPQ9BX97 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PLVAPQ9BX97 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PLVAPQ9BX97 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PLVAPQ9BX97 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLVAPQ9BX97 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLVAPQ9BX97 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PLVAPQ9BX97 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PLVAPQ9BX97 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PLVAPQ9BX97 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLVAPQ9BX97 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PLVAPQ9BX97 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PLVAPQ9BX97 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLVAPQ9BX97 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PLVAPQ9BX97 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLVAPQ9BX97 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLVAPQ9BX97 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLVAPQ9BX97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLVAPQ9BX97 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLVAPQ9BX97 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLVAPQ9BX97 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLVAPQ9BX97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLVAPQ9BX97 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLVAPQ9BX97 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLVAPQ9BX97 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLVAPQ9BX97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PLVAPQ9BX97 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLVAPQ9BX97 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLVAPQ9BX97 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLVAPQ9BX97 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLVAPQ9BX97 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLVAPQ9BX97 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLVAPQ9BX97 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLVAPQ9BX97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms