Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RPS6KC1Q96S38 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RPS6KC1Q96S38 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RPS6KC1Q96S38 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RPS6KC1Q96S38 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RPS6KC1Q96S38 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RPS6KC1Q96S38 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RPS6KC1Q96S38 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RPS6KC1Q96S38 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RPS6KC1Q96S38 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RPS6KC1Q96S38 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RPS6KC1Q96S38 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RPS6KC1Q96S38 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RPS6KC1Q96S38 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RPS6KC1Q96S38 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RPS6KC1Q96S38 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RPS6KC1Q96S38 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
RPS6KC1Q96S38 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RPS6KC1Q96S38 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RPS6KC1Q96S38 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RPS6KC1Q96S38 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RPS6KC1Q96S38 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RPS6KC1Q96S38 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RPS6KC1Q96S38 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPS6KC1Q96S38 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPS6KC1Q96S38 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPS6KC1Q96S38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPS6KC1Q96S38 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RPS6KC1Q96S38 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPS6KC1Q96S38 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPS6KC1Q96S38 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RPS6KC1Q96S38 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPS6KC1Q96S38 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPS6KC1Q96S38 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPS6KC1Q96S38 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPS6KC1Q96S38 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPS6KC1Q96S38 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPS6KC1Q96S38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RPS6KC1Q96S38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RPS6KC1Q96S38 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RPS6KC1Q96S38 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RPS6KC1Q96S38 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RPS6KC1Q96S38 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RPS6KC1Q96S38 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RPS6KC1Q96S38 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RPS6KC1Q96S38 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms