Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARXQ96QS3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARXQ96QS3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARXQ96QS3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
ARXQ96QS3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARXQ96QS3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARXQ96QS3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARXQ96QS3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARXQ96QS3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ARXQ96QS3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARXQ96QS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ARXQ96QS3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
ARXQ96QS3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARXQ96QS3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARXQ96QS3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARXQ96QS3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARXQ96QS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARXQ96QS3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARXQ96QS3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ARXQ96QS3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ARXQ96QS3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARXQ96QS3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ARXQ96QS3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ARXQ96QS3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARXQ96QS3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARXQ96QS3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
ARXQ96QS3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARXQ96QS3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARXQ96QS3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARXQ96QS3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARXQ96QS3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARXQ96QS3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARXQ96QS3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARXQ96QS3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARXQ96QS3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARXQ96QS3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARXQ96QS3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARXQ96QS3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARXQ96QS3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARXQ96QS3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARXQ96QS3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARXQ96QS3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARXQ96QS3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARXQ96QS3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARXQ96QS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARXQ96QS3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARXQ96QS3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARXQ96QS3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARXQ96QS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARXQ96QS3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARXQ96QS3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARXQ96QS3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARXQ96QS3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARXQ96QS3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARXQ96QS3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARXQ96QS3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARXQ96QS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARXQ96QS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARXQ96QS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms