Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ7

KLHL5, Kelch-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL5Q96PQ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHL5Q96PQ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KLHL5Q96PQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KLHL5Q96PQ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KLHL5Q96PQ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KLHL5Q96PQ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL5Q96PQ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL5Q96PQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KLHL5Q96PQ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KLHL5Q96PQ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KLHL5Q96PQ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KLHL5Q96PQ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KLHL5Q96PQ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KLHL5Q96PQ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KLHL5Q96PQ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KLHL5Q96PQ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KLHL5Q96PQ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KLHL5Q96PQ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KLHL5Q96PQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KLHL5Q96PQ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KLHL5Q96PQ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KLHL5Q96PQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHL5Q96PQ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHL5Q96PQ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KLHL5Q96PQ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
KLHL5Q96PQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHL5Q96PQ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KLHL5Q96PQ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KLHL5Q96PQ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KLHL5Q96PQ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHL5Q96PQ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHL5Q96PQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KLHL5Q96PQ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHL5Q96PQ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KLHL5Q96PQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL5Q96PQ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL5Q96PQ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KLHL5Q96PQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KLHL5Q96PQ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KLHL5Q96PQ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KLHL5Q96PQ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KLHL5Q96PQ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KLHL5Q96PQ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
KLHL5Q96PQ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL5Q96PQ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KLHL5Q96PQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL5Q96PQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL5Q96PQ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHL5Q96PQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL5Q96PQ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHL5Q96PQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHL5Q96PQ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL5Q96PQ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL5Q96PQ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms