Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM47Q96LD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM47Q96LD4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM47Q96LD4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM47Q96LD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM47Q96LD4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM47Q96LD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM47Q96LD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM47Q96LD4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM47Q96LD4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM47Q96LD4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM47Q96LD4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM47Q96LD4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM47Q96LD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM47Q96LD4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM47Q96LD4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM47Q96LD4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM47Q96LD4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM47Q96LD4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM47Q96LD4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM47Q96LD4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM47Q96LD4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM47Q96LD4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM47Q96LD4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM47Q96LD4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM47Q96LD4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM47Q96LD4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM47Q96LD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM47Q96LD4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM47Q96LD4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM47Q96LD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM47Q96LD4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM47Q96LD4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM47Q96LD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM47Q96LD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM47Q96LD4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM47Q96LD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM47Q96LD4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM47Q96LD4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM47Q96LD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM47Q96LD4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM47Q96LD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM47Q96LD4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM47Q96LD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM47Q96LD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM47Q96LD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM47Q96LD4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM47Q96LD4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM47Q96LD4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM47Q96LD4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM47Q96LD4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM47Q96LD4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM47Q96LD4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM47Q96LD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM47Q96LD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRIM47Q96LD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TRIM47Q96LD4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRIM47Q96LD4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRIM47Q96LD4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRIM47Q96LD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms