Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA1

POM121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121Q96HA1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POM121Q96HA1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POM121Q96HA1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POM121Q96HA1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POM121Q96HA1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POM121Q96HA1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POM121Q96HA1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POM121Q96HA1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POM121Q96HA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POM121Q96HA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POM121Q96HA1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POM121Q96HA1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POM121Q96HA1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POM121Q96HA1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POM121Q96HA1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POM121Q96HA1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POM121Q96HA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POM121Q96HA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POM121Q96HA1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POM121Q96HA1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POM121Q96HA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POM121Q96HA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POM121Q96HA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POM121Q96HA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POM121Q96HA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121Q96HA1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121Q96HA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121Q96HA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POM121Q96HA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POM121Q96HA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms